Suomen Humanistiyhdistys perustettiin 28.4.1968 Helsingissä yliopiston pienessä juhlasalissa. Paikalliset humanistiyhdistykset liittyivät Humanistiliitoksi 1980-luvulla.

Puheenjohtajat:

1999 -               Pekka Elo (31.10.99-)
1993 - 1999      Gun Väyrynen
1992 - 1993      Sirkka Kuikka
1982 - 1992      Jussi Pikkusaari
1980 - 1982      Kaarlo Helasvuo
1970 - luvulla    Jorma Taarna
1960 - luvulla    Matti Luoma

Vuonna 1987 Suomen Humanistiyhdistys muuttui Helsingin humanistiyhdistykseksi, ja yhdessä muutaman muun maassa toimivan yhdistyksen kanssa yhdistykset perustivat Suomen Humanistiliiton. Humanistiyhdistyksiä on 3 paikkakunnalla.